诸葛恢年少知名，起家即丘县长，迁临沂县令。
八王之乱时，南渡江东，效力于琅琊王
司马睿，出任安东主簿、江宁县令。从讨
周馥有功，封博陵亭侯，迁镇东参军、丞相从事中郎。晋愍帝
司马邺即位后，授尚书郎、会稽太守。政绩优异，受到朝廷褒奖。东晋建立后，历任中书令、丹阳尹，因病免官。
太宁二年（324年），晋明帝
司马绍征讨
王敦，以诸葛恢为侍中、奉车都尉，后因击败
王含有功，进爵建安伯，历任会稽太守、侍中、左民尚书、武陵王师、散骑常侍、吏部尚书、右仆射、尚书令等职。
晋成帝病危，诸葛恢被选为顾命大臣，辅佐朝政。
晋康帝继位，加授金紫光禄大夫。
永和元年（345年）去世，时年六十二岁，获赠侍中、左光禄大夫、仪同三司，谥号为敬。著有个人文集五卷。与
荀闿、
蔡谟号称“
中兴三明”，当时的人说：“京都三明各有名，蔡氏儒雅荀葛清。”
