肽酶是一种能够水解肽链的酶，是国际生物化学和分子生物学联盟命名委员会（Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology，NC-IUBMB）推荐的作为所有蛋白水解酶的一般术语，可以分为两大类型，即内肽酶(E.C.3.4.21~3.4.99)和外肽酶(E.C.3.4.11~3.4.19)：
其中
内肽酶
作用于多肽链内部的特定肽键，如存在于动物消化道的
胃蛋白酶
、
胰蛋白酶
和
糜蛋白酶
等，这些酶对不同氨基酸组成的肽键有特异性；
外肽酶
作用于蛋白质肽链两端肽键的酶，作用于氨基端肽键的称
氨基肽酶
，作用于羧基端肽键的称为羧基肽酶。食物
蛋白质
在
消化道
中经过各种肽酶的连续作用，最后分解成为游离
氨基酸
。
