蛋白质水解生成的氨基酸在体内的代谢包括两个方面，一方面主要用以合成机体自身所特有的蛋白质、 多肽及其他 含氮物质。另一方面可通过 脱氨作用， 转氨作用， 联合脱氨或 脱羧作用，分解成α-酮酸、胺类及 二氧化碳。氨基酸分解所生成的α-酮酸可以转变成糖、脂类或再合成某些 非必需氨基酸，也可以经过三羧酸循环氧化成二氧化碳和水，并放出能量。