学校于1958年6月经广州市人民委员会批准设立,原名广州医学院。1970年12月,更名为广州市医科学校。1973年6月,恢复
广州医学院名称。2013年4月,经教育部批准更名为广州医科大学。
根据2021年4月学校官网显示,学校共有番禺、越秀两个校区,占地面积37.23万平方米,建筑面积48.65万平方米;下设22个学院,7所直属医院和11所非直属附属医院,28个研究机构;拥有省级试点学院3个、省级产业学院1个;有教职工7789人(其中校本部908人);有全日制本科生和研究生12602人,在校留学生285人;拥有19个国家临床重点专科,74个省(部)级重点专科,32个市(厅)级重点学科;6个学科进入ESI排名全球前1%;拥有1个博士后流动站,2个一级学科博士点,8个一级学科硕士点,5个专业学位硕士点,1个独立二级学科硕士点;开设本科招生专业21个。