私立南通大学（Nantung University）是由私立南通医科大学、私立南通纺织大学和 私立南通农科大学于1928年合并组建而成， 张孝若为首任校长。因 中华民国《大学组织法》中尚无纺织学院，私立南通大学于1930年11月暂称为私立南通学院。  

私立南通大学是中国最早创办的农业高等院校之一（1902年 张謇创办的通海农学堂，1906年成为通州师范学校附设农科），中国最早创办的医学高等院校之一（1912年张謇创办的 私立南通医学专门学校）和中国最早创办的纺织高等院校（1912年张謇创办的纺织染传习所，同年改称“南通纺织学校”，1913年定名“南通纺织专门学校”）。

私立南通大学纺织科曾拥有“中国纺织工程师的摇篮”“中国纺织黄埔军校”的美誉。著名历史学家、 汉学家、哈佛大学教授 费正清（John King Fairbank）认为：“南通大学是近代中国私立科技大学的代表”。

1949年9月，南通农学院农业经济学系学生并入 浙江大学 ^[11]   。1952年全国高校院系调整时，私立南通学院撤销建制，相关系科外迁， 农科参与组建苏北农学院 ^[18]   ，后来发展成为 扬州大学农学院 ^[17]   ，纺织科参与组建华东纺织工学院 ^[15]   ，后来发展成为 东华大学   ；医科独立为南通医学院   ^[14]   ，1957年迁往苏州成立苏州医学院   ，后来发展成为 苏州大学医学部   。南通医学院（由原南通医学院留通部分发展而来 ^[14]   ）、南通工学院（由1977年复建的纺织院校发展而来 ^{[12]   [15]}   ）、南通师范学院三所公办本科高校于2004年合并组建省属公办的 南通大学（Nantong University）。   ^[16]