理藩院是 清朝政府统治 蒙古、 回部及 西藏等 少数民族的最高权力机构。   洋务运动前也负责处理对 俄罗斯的外交事务。理藩院初掌蒙古事，随着清廷全国政权的建立，更为总管蒙古、西藏、新疆等各少数民族地区事务的 中央机构。清统治者通过理藩院实施对各少数民族地区的统治，加强与他们的联系。康熙年间，修定《 理藩院则例》，用法规固定了对少数民族地区统治的各项措施。以后又四次 校修。

理藩院 六司分掌 爵禄、 朝贡、 定界、 官制、 兵刑、 户口、 耕牧、 赋税 、 驿站、 贸易、 宗教等政令。理藩院所辖，先后设有内馆、外馆、蒙古学、 唐古特学、托忒（卫拉特）学、俄罗斯学， 木兰围场、 喇嘛印务处，则例馆等机构。此外还派司员， 笔帖式等常驻少数民族地方，处理特定事务，定期轮换。 光绪三十二年（1906年），理藩院更名为 理藩部，辛亥革命后 北洋政府改为 蒙藏院。