喀什噶尔参赞大臣，是清代官职名，指 清代新疆 回部地方的驻扎大臣。“总理回部各城事务”。

乾隆二十四年（ 1759年）始置，清政府在平定新疆南部的 大小和卓叛乱以后，鉴于当时的周边环境，经过慎密的事前考察后，在新疆实施了军政合一、以军统政的行政管理制度——军府制。因其驻 喀什噶尔（今新疆 喀什市）办事，故称喀什噶尔参赞大臣。

乾隆二十八年（1763年），以喀什噶尔参赞大臣“总理回疆事务”，驻喀什噶尔新城（即后来的 徕宁城）。

光绪十年（1884年）11月，新疆建 行省，喀什噶尔参赞大臣辖地俱改府、州、直隶厅，参赞大臣遂裁撤。