20世纪下半叶以来,土库曼斯坦建成
卡拉库姆运河后,入咸海水量减少至70亿立方米。咸海面积缩小了一半,水中含盐量增加了三倍,沿海
沼泽面积大大缩小,大量灌木消失。锡尔河
三角洲鸟类减少了135种,咸海鱼类由24种减少到4种。
随着水位不断下降,咸海于1987年分成了
南咸海和
北咸海两片水域,完工于1988年的卡拉库姆运河输送了1290万立方米的水量(相当于阿姆河总流量的15%),
其中南咸海于2003年又进一步分成了东、西两部分。到2014年时南咸海大部分干涸消失,但北咸海面积基本恢复。