《中日通商行船条约》是《 马关条约》的延续。多年来日本统治者企图在中国得到的各种特权，至此全部实现。《马关条约》第六条规定：中日两国所有约章已因甲午战争而废绝，双方应派代表商订通商行船条约；新订约章应以中国与欧美各国现行约章为本。据此，1895年12月日本代表驻华公使林董与中国代表（初为李鸿章，后改为张荫桓）开始谈判。日方提出约稿条款，双方根本上一致。所以历时半年的谈判虽有不少争辩，最后还是在日方约稿的范围内定议。1896年（光绪二十二年）7月21日张荫桓与林董签订《通商行船条约》。