中国科学院合肥物质科学研究院（Hefei Institutes of Physical Science, Chinese Academy of Sciences）是中国科学院所属的综合性科研机构之一。  

中国科学院合肥物质科学研究院的历史可追溯至2001年11月由原 中国科学院合肥分院及安徽光学精密机械研究所、等离子体物理研究所、固体物理研究所合并而成的中国科学院合肥研究院；2003年5月，正式批复合并为中国科学院合肥物质科学研究院；2004年4月，合肥智能机械研究所划归该研究院。  

据2021年2月中国科学院合肥物质科学研究院官网，该院面积2.65平方公里，设有5个博士后流动站、17个博士点和20个硕士点；有职工2700名，在学研究生约2000名。