陕西省考古研究院成立于1958年10月，原名 中国科学院陕西分院考古研究所，1963年归属 陕西省社会科学院，后改名为陕西省考古研究所。1970年1月，陕西省考古研究所与 陕西省博物馆、陕西省文物管理委员会合并。1978年10月，经中共陕西省委办公厅批准恢复陕西省考古研究所建制，1984年划归 陕西省文物局管理。

2006年12月31日 ，经陕西省编制委员会批准更名为陕西省考古研究院。陕西省考古研究院是全国成立最早、规模最大的省级考古科研机构，主要承担陕西省境内的考古调查、勘探、发掘和研究任务。