陆地蓝洞中的水质从上到下一般分为淡水层、硫化氢层、无氧层。

淡水层的水可以饮用；硫化氢层的水含有微生物代谢的大量 硫化氢，会腐蚀人的肌肤；无氧层虽然不能保存动物的肌肉，但是甲壳骨骼可以得到几乎完美的保存，故而也被古生物学界称为天然的历史博物馆。