线粒体基质-内膜和 嵴包围着的线粒体内部空间， 含有很多 蛋白质和 脂类，催化 三羧酸循环中脂肪酸和丙酮酸氧化的 酶类， 也都存在于基质中。线粒体有内外两层膜,内膜的某些部位向线粒体的内腔折叠形成嵴,【嵴】的周围充满了液态的基质----这些基质就是线粒体基质,其中含有许多有氧呼吸有关的酶.是有氧呼吸的主要场所。