系统生物学的医学应用研究，采用组学生物技术、计算机数学建模和基因生物技术等规模化、系统化与高通量化研究生物医学的学科，包括，生物系统理论和 系统生物技术在生物医学研究中的应用。

系统生物医学（system bio-medicine）等价于 系统医学与药物学（systems medicine & pharmacology）概念。系统生物医学是采用系统论方法研究生物医学，也就是 系统生物学的医学应用研究。1992年，日本Kamada T.发表了题头为系统生物医学（system bio-medicine）词汇的论文，同时，中国 曾邦哲（Zeng BJ.）1992年4月于首届全国中西医学比较研讨会（广州）阐述了系统 医药学（systems medicine and pharmacology）的概念与模型，并在1999年创立的Genbrain Biosystem Network上世纪之初启用了“Science and Engineering of Biosystem”和“Biosystem Medicine”等词汇。