科技日报社是中编办批准设立、由科学技术部代管的副部级事业单位。

2019年9月，经党中央批准，十九届中央第四轮巡视将对科技日报社党组织开展常规巡视。   2020年11月19日，科技日报社“《追问新冠肺炎》系列报道”被评为2020中国新媒体战“疫”精品案例。