百崎回族乡位于 惠安县南部沿海， 泉州湾北部， 洛阳江入海处。东与 张坂镇交界，西与 洛阳镇毗邻，南与 东园镇接连，西南与泉州市丰泽区 东海街道及 后渚港相望，北与 东园镇接连。

1990年8月经福建省人民政府批准，独立建制百崎回族乡，是福建省18个少数民族乡中唯一的 回族乡，也是泉州市唯一的少数民族乡。先后被评为“泉州市民族团结与进步模范集体”、   “泉州市‘四五’普法先进乡镇”、   “泉州市平安乡镇”、   “泉州市人口与计划生育工作先进单位”、   “惠安县文明乡镇”、   “惠安县农村工作先进单位”、   “惠安县党建工作先进党委”、   “惠安县安全生产工作先进单位”。  

2017年，行政区域面积1670公顷，常住人口25430人   。

百崎回族乡地势平坦。下辖白奇、里春、莲埭、下埭、后海5个行政村、13个自然村，为回族聚居地。百崎回族乡主要名胜有百崎郭氏家庙、接官亭等。