梅花山自然保护区于1985年4月经福建省人民政府批准建立，1988年5月经国务院批准列为国家级森林和野生动物类型自然保护区，保护区地处福建西南部，是武夷山脉南段与博平岭之间的玳瑁山的主体部分，为上杭、连城、龙岩三县（市）交界地带，俗称“梅花十八洞”。

2021年2月5日，被中国林学会命名为第五批全国林草科普基地。