昆明医科大学的前身是创建于1933年的东陆大学医学专修科,1956年独立建院,定名为昆明医学院,2012年经教育部批准更名为昆明医科大学,1981年成为全国首批硕士学位授予单位,1993年被列为省属重点院校,1998年获准为博士学位授予单位,2010年云南医学高等专科学校并入。
截至2020年11月,学校有呈贡(主校区)、人民西路、平政三个校区,校园占地面积1482亩;设有学院(部)18个,本科专业33个;有博士后科研流动站3个,一级学科博士学位授权点3个,一级学科硕士学位授权点7个,二级学科硕士学位授权点4个,博士专业学位授权点1个,硕士专业学位授权点6个;有4所直属附属医院、13所非直属附属医院、15所教学医院;有在编职工6090人(校本部1587人,直属附属医院4503人),全日制在校生19909人,其中本科生14845人,硕士研究生3794人,博士研究生451人,留学生524人,专科生295人。