日本学术会议（ 日语：日本学术会议/にほんがくじゅつかいぎ、 英语：Science Council of Japan），是属于 日本 内阁府的特别机关。

日本学术会议的前身是于1920年成立之“学术研究会议”，其后为因应新的研究体制，乃改组为日本学术会议。其会员由成员 直接选举产生，属于 总理府，直属于 内阁总理大臣，被定位为特别 机构。 昭和23年（1948年）选出第一届会员210名，并于翌年1月开始运作。1956年，日本学士院法公布，乃将 日本学士院独立分离，隶属于文部大臣。1983年，修订日本学术会议法，将会员直选的制度，改由学术研究团体推荐产生。