故宫研究院是对 故宫博物院已有的学术研究力量的整合。是故宫博物院设立的学术研究与交流的非建制机构。2013年10月23日，故宫研究院正式挂牌。

下设书画研究所，陶瓷研究所，古建筑研究所，藏传佛教文物研究所， 文博法治研究所，考古研究所，古文献研究所，宫廷戏曲研究所，明清宫廷制作技艺研究所，宫廷园艺研究所，中国画法研究所，中外文化交流研究所，研究室，故宫学研究所，明清宫廷历史档案研究所。  

2018年10月， 故宫研究院中医药文化研究所举行揭牌仪式。