广西中医药大学源于1934年成立的广西省立南宁区医药研究所,1941年省立南宁区、梧州区、桂林区三所医药研究所合并为广西省立医药研究所,1945年广西省立医药研究所改名为广西省立南宁高级中医职业学校,1949年12月学校停办,1956年恢复办学,成立南宁中医学校。1957年梧州中医学校并入组成广西中医学校,1958年更名为广西中医专科学校,1964年升格为
广西中医学院,1970年南宁医学专科学校并入,组建新的广西中医学院。2012年3月经教育部批准正式更名为广西中医药大学。
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截至2019年5月,学校有仙葫、明秀2个校区,总占地面积1110.93亩,总建筑面积52万平方米。设有14个学院,3个直属公共教学部,开办27个本科专业,13个专科专业(方向);有博士学位授权一级学科1个、硕士学位授权一级学科6个;专任教师1025人,外聘教师82人;全日制在校生14000多人。