山东大学医学院位于 山东大学趵突泉校区，是中国最早的医学院校之一，前身为创建于1911年4月17日的 齐鲁大学医学院，历史可追溯到1864年成立的登州文会馆和1891年成立的华美医院医校。1952年9月由齐鲁大学医学院、 山东省立医学院、 华东白求恩医学院重组成山东医学院，1978年划归卫生部直属，1985年更名为 山东医科大学。

2000年7月，山东大学、山东医科大学、 山东工业大学合并成立新山东大学后，以山东医科大学基础医学院和临床医学部组建医学院，成为山东大学规模最大的学院。2012年5月 山东大学齐鲁医学部成立，医学院成为其分管学院。

2016年7月1日，根据山东大学《医学教育管理体制改革实施方案》，撤销医学院建制，成立 山东大学基础医学院和 山东大学临床医学院。   此后情况请查阅对应词条。

历经百年风雨，医学院形成了“博施济众、广智求真”，“精益求精、无私奉献”的优良传统，把培养医术精湛、医德高尚，具有国际视野和社会责任感的医学人才作为历史使命，在改善民生、促进人民健康事业中做出了巨大的贡献。