子囊菌亚门（Ascomycotina） 真菌门中最大的一亚门。该亚门与 担子菌亚门因结构复杂，合称高等真菌。主要特征是营养体除极少数低等类型为单细胞（如酵母菌）外，均为 有隔菌丝构成的菌丝体。细胞壁由几丁质构成。有性过程中形成子囊，是子囊菌有性过程中进行核配和减数分裂发生的场所，在子囊中产生具有一定数目（多为8个，有的为4个、16个或其他数目）的 子囊孢子。