南京最早的福音是在清同治6年（1867年），由英国内地会传教士童根福从苏州传来，由于语言不通未果。清同治12年（1873年），美国北美长老会的韦理夫妇，次年李满夫妇来南京传道。1884年，建成“四根杆子礼拜堂”，可容纳100人。清光绪10年（1884年），建成明德女中（今南京市女子中专学校）。清光绪14年（1888年），李满在明德女中东面建起一座正规的教堂，叫“耶稣会堂”，可容纳400人。清宣统2年（1910年），聘请山东长老会的孙喜圣为该堂牧师，共17年，为中国首任华人牧师。