吉林市公安局设有指挥中心、政治部、纪检组、监察处、警务保障处、警务督察支队、审计处、控告申诉处、法制支队、户政管理支队、科技通信处、出入境管理局、情报处、经济文化保卫支队、治安管理支队、刑事犯罪侦查支队、监所管理支队、经济犯罪侦查支队、禁毒支队、网络安全保卫支队、特警支队、技术侦察支队、视频侦查支队、交通管理支队、人民警察训练支队、城管治安管理支队、船营分局、昌邑分局、龙潭分局、丰满分局、高新技术产业开发区分局、经济技术开发区分局、江北分局、公交分局、松花湖旅游风景区分局，分别承担有关业务工作。