北京城市副中心站是 京唐城际铁路和 京滨城际铁路（京唐共线段）的设计起点以及建成初期的运营始发/终到站，同时也是城际铁路联络线（ 北京首都国际机场~ 北京大兴国际机场）的重要枢纽站。

城市副中心火车站位于通州杨坨地区，北边是运潮减河、南边是北运河。  

北京城市副中心站为8台16线地下车站，根据环评报告书中所示的站线配布图，还将预留与京哈线联通的市郊/普速列车站台。未来， 北京地铁22号线（平谷线）、北京地铁M101线（北京通州地铁1号线）、 北京地铁6号线也将在本站实现换乘。

北京城市副中心站为京唐城际铁路上报国家发改委的环评报告书中所标注的暂定名称。