分子马达（molecular motor）是指由生物大分子构成，利用化学能进行机械做功的纳米系统。生命体的一切活动，包括肌肉收缩、物质运输、DNA复制、细胞分裂等，追踪到分子水平都是来源于具有马达功能的蛋白质大分子做功推送的结果，因此它们被称为分子马达或蛋白质马达。