中国科学院系统控制重点实验室，依托中国科学院数学与系统科学研究院。系统控制重点实验室于1994年底经中国科学院批准正式成立。其前身是1962年3月成立于中国科学院数学研究所的控制理论研究室，是我国最早从事现代控制理论研究的单位。

首任室主任为著名科学家 关肇直院士、副主任为 宋健院士。现任实验室主任为 洪奕光研究员。研究方向有随机系统、 非线性系统、分布参数系统、 离散事件动态系统、参数估计、适应控制、鲁棒控制、网络信息论、复杂系统与复杂性、量子控制、先进控制系统设计方法研究等。本着开拓创新、与时俱进的精神，许多新的生长点不断涌现。