中国科学院水生生物研究所，位于 湖北省 武汉市， 珞珈山麓、 东湖之滨。研究所前身是1930年1月在南京成立的 国立中央研究院自然历史博物馆，经历数次重组、迁址、改隶后，1950年2月定名为中国科学院水生生物研究所，1954年9月由 上海迁至 武汉。  

中国科学院水生生物研究所是从事内陆水体生命过程、生态环境保护与生物资源利用研究的综合性学术研究机构，水生所战略定位和发展目标是，面向国家在水环境保护、渔业可持续发展和微藻生物能源利用方面的重大战略需求，围绕内陆水体生命过程、生态环境保护与生物资源利用领域的基础性、战略性和前瞻性重大科技问题，着力重大理论创新和核心技术突破，强化创新价值链的延伸，在水环境保护、淡水渔业和微藻生物能源领域发挥引领示范作用。  

据2016年1月研究所官网显示，该研究所有在职职工367人，其中科技人员292人，研究员及正高职称人员62人，副研究员及副高职称人员73人，其中 中国科学院院士6人，博士生导师68人，硕士生导师56人；拥有12个研究部门，包括一个 国家重点实验室，一个 中国科学院重点实验室。