中国科学院植物研究所前身为1928年创建的 静生生物调查所和1929年成立的北平研究院植物研究所，1950年合并为中国科学院植物分类研究所，1953年改为中国科学院植物研究所。  

研究所以整合 植物生物学为学科定位，以植物对环境适应的生物学基础为主要研究方向，以绿色高效农业和生态环境的国家需求为重要研究领域，重点在植物系统发育重建和进化、陆地植被/生态系统与全球变化、资源植物分子与 发育生物学、植物信号转导与代谢组学、生物多样性保育与可持续利用等方面开展系统的研究。  

据2015年12月研究所官网显示，研究所占地74公顷，18个研究部门，7个学术协会；有 中国科学院院士5人，在岗博士研究生导师66人，在岗硕士研究生导师83人，在学研究生604人，在站博士后51人。