中国企业发展研究中心成立于1994年，是根据党中央、 国务院关于加强、加快建立 现代企业制度指示，由 国务院发展研究中心发起成立的由 中国国情研究会主管的事业单位科研机构。国务院发展研究中心前主任 孙尚清任第一届主任。

中国企业发展研究中心自成立后，一直得到党和国家领导人的亲切关怀，中心先后组成了顾问团，为加强企业研究形成了一支科学的 科研队伍，为建立现代化企业制度做出了大量的工作和贡献   。

该中心接到 群众 举报，一些社会人员冒用该中心名义在境外注册了同名组织，在北京、云南、广西一带开展非法活动，该中心及时向主管单位进行了通报，并通过官网发表了 声明。   2016年5月， 民政部民间组织管理局主管的 中国社会组织网曝光第六批“ 离岸社团”“ 山寨社团”名单，中国企业发展研究中心在名单中。