中国科学院上海药物研究所前身是国立北平研究院药物研究所，创建于1932年，次年迁至 上海，2003年搬迁至 浦东 张江高科技园区，是中国历史最悠久的综合性创新药物研究机构   。

上海药物所瞄准国际 生命科学发展的开展创新药物基础和应用基础研究，发展药物研究新理论、新方法和新技术。围绕治疗 恶性肿瘤、心脑血管系统疾病、神经精神系统疾病、 代谢性疾病、 自身免疫性疾病及 感染性疾病等开展新药研发，加强现代中药的研发   。

截至2014年底，上海药物所共有在职职工778人，包括中国科学院院士3人、中国工程院院士3人；有4个国家级研究中心，6个研究室，11个技术平台研究中心；有一级学科博士研究生培养点1个，一级学科硕士研究生培养点1个，博士后流动站2个   。