芜湖三山经济开发区前身为“芜湖三山绿色食品经济开发区”，于2001年3月开工建设，规划面积10平方公里，一期规划面积为3.5平方公里。2004年10月被农业部命名为全国农产品加工业示范基地，2005年11月被省经委批准为安徽省中小企业创业基地，2006年4月经省政府批准为省级开发区。2009年5月，原三山区委、区政府决定将绿色食品经济开发区和临江工业区整体合并。2009年7月1日，经省政府批准同意更名为“安徽芜湖三山经济开发区”。总规划面积319.8平方公里，建成区面积17.5平方公里。2020年7月6日，三山区和弋江区合并成立弋江区，2020年9月22日原三山区管辖范围全部委托至安徽芜湖三山经济开发区管辖。